1、购买单位不同。省公积金一般是铁路单位、国家机关单位买的，由省直住房公积金中心管理；一般的企业都是买市公积金，由市直住房公积金中心管理；
2、可用地点不同。省级公积金可用于全省，市级公积金只能用于全市内。简而言之，如果买的是省公积金，那么在省办理住房贷款或租房都可以，而市公积金只能在市有效，出了市公积金就不能用了；
3、还贷方式不同。如为组合贷款，省公积金，可先偿还部分商业贷款，再偿还部分公积金；市公积金，则需按规定比例同时偿还，可能年限较长；
4、贷款金额和条件不同。省级公积金与市级公积金在贷款额度上会有一定的差异，一般而言，使用省级公积金贷款首付占两成即可，市级公积金首付则需三成，如四川地区。但各地具体政策不同，如湖南省直公积金与市公积金在贷款比例上无差异，但申请贷款的条件不同。省级公积金需连续缴纳6个月以上，长沙市公积金需连续缴纳12个月以上；可贷额度计算方法也存在差异。省级公积金可贷额度=（月缴存额*12*未来可缴年限+个人账户余额）*2。长沙市公积金贷款额=公积金存款余额*13倍。
购买者不同，可用地点不同，省公积金可以在全省内用，市公积金只能再市内用的。
还贷方式不同，占的比例不同，具体的情况还得具体细分，希望能够帮助你。
本质上一样，只是审查的机构不太一样
